تعیین تعاملات پروتئین-پروتئین در بافت گلبول قرمز به عنوان مدلی از بافت های انسانی

پایان نامه
چکیده

گلبول قرمز از اصلی ترین اجزای خون است و مهمترین وظیفه ی آن، که توسط هموگلوبین موجود در گلبول قرمز انجام می شود، انتقال اکسیژن و دی اکسید کربن است. بسیاری از بیماری های مربوط به گلبول قرمز ناشی از تعاملات نادرست پروتئین-پروتئین می باشد. از این رو، شناخت این تعاملات راهی برای کشف مکانیسم بیماری ها و طراحی داروهای جدید می باشد. بر اساس این اطلاعات روش های مقابله با تکثیر سلولهای سرطانی طراحی می شود و مسیرهای رشد آنها مسدود میگردد.در این پایان نامه به بررسی تعاملات پروتئین-پروتئین در بافت گلبول قرمز با استفاده از روش های کلاس بندی پرداخته ایم. داده های مورد نیاز از پایگاه داده های تعاملات پروتئینی گرفته شده است. 4 نوع مختلف از بردارهای ویژگی با استفاده از توالی آمینواسیدی تولید شده است که شامل درصد فراوانی نسبی آمینواسیدها، واحدهای سه جزئی متحد، گراف آمینواسیدی و خواص فیزیکوشیمیایی است. روش های کلاس بندی استفاده شده شبکه های عصبی مصنوعی، ماشین بردار پشتیبان، مدل های بیز (بیز ساده و شبکه بیزیtan) و جنگل تصادفی می باشد.عملکرد هر 4 ویژگی با وجود تفاوت ابعاد آنها بسیار خوب بوده است و دقت حاصل با توجه به روش مناسب کلاس بندی در حدود 84% می باشد. در بین روش های کلاس بندی دو روش ماشین بردار پشتیبان و جنگل تصادفی بهترین کارایی را در کلاس بندی داده های تعاملات پروتئین-پروتئین در بافت گلبول قرمز داشته اند. ضعیف ترین عملکرد کلاس بندی مربوط به شبکه های عصبی مصنوعی بوده است.

منابع مشابه

بررسی اثر سمی نانونقره بر گلبول قرمز خون و بافت کبد ماهی کپور معمولی (Cyprinus carpio)

تحقیق فعلی با هدف اثر سمی نانونقره بر گلبول قرمز خون و بافت کبد ماهی کپورمعمولی (Cyprinus carpio)مورد بررسی قرار گرفت. در این تحقیق از نانونقره با اندازه‌ های 10-50 نانومتر و با غلظت‌ های 10، 25، 50 و100 میکروگرم بر لیتر استفاده شد. در روش Neutral Red Retention Assay (NRR)، تغییرات سلولی با استفاده از میکروسکوپ نوری در فواصل زمانی 15، 30، 60، 90، 120، 150 و180 دقیقه پس از افزو...

متن کامل

بافت شناسی گلبول های قرمز و بررسی برخی فاکتورهای بیوشیمیایی سرم خون گربه کوسه لکه دار (Chiloscyllium punctatum) خلیج فارس

بررسی وآنالیزهماتولوژیوبیوشیمیاییسرمخون شاملالکترولیت‌ ها وغیرالکترولیت ‌ها یکیازبهترین راه ‌هایتشخیصبیماریدرآبزیانمی ‌باشد که عواملمتعددیآن را دست خوش تغییرات می ‌کنند. دراین تحقیق تعداد 30 قطعه گربه کوسه لکه ‌دار (Chiloscyllium punctatum) با خصوصیات زیست ‌سنجی مشابه از هر دو جنس از خور درویش در شمال خلیج فارس صید شدند. پس از خون‌ گیری، رنگ ‌آمیزی، تهیه گسترش و جداسازی سرم، ا...

متن کامل

آماده‌سازی داربست‌های سه بعدی سلول‌زدایی شده به عنوان مدلی برای مهندسی بافت و ارزیابی عملکرد آنها با استفاده از بافت بلاستما در شرایط آزمایشگاهی

مهندسی بافت براساس سه ترکیب اصلی بافت‌های بیولوژیکی شامل داربست، سلول و عوامل رشد بنیان نهاده شده است. داربست‌های زیستی مشتق از بافت‌ها و اندام‌های سلول‌زدایی شده به‌طور موفقیت‌آمیزی در مهندسی بافت مورد استفاده قرار گرفته‌اند. مطالعات سلول‌زدایی بیانگر آن است که داربست‌های طبیعی حاصل از بافت‌های سلول‌زدایی شده، با حفظ ترکیبات اصلی می‌توانند بستر مناسبی برای بررسی رفتارهای سلولی باشند و آماده‌سا...

متن کامل

جداسازی پروتئین LMG از بافت کبد موش و میانکنش آن با

ABSTRACT In eukaryote cells, DNA is complexed with a series of basic proteins making units of chromatin structure named nucleosomes. In addition, nonhistone proteins with different function are the components of chromatin. Among these proteins, a group with a low mobility on gel electrophoresis have been identified and named LMG. In this study a LMG protein with a molecular weigh of 160 ...

متن کامل

تشخیص پره‌اکلامپسی از طریق تعیین نسبت پروتئین به کراتی‌نین ادرار

زمینه : دفع پروتئین در ادرار مهمترین عامل تشخیص و اداره بیماران مبتلا به پرهاکلامپسی است. استفاده از روشی که بتواند در اسرع وقت میزان پروتئین ادرار را نشان دهد، در تسریع روند درمان مؤثر است. هدف : مطالعه به منظور تعیین میزان پروتئین ادرار 24 ساعته از طریق تعیین نسبت پروتئین به کراتینین یک نمونه تصادفی ادرار در زنان باردار مشکوک به پره اکلامپسی انجام شد. مواد و روش‌ها: این مطالعه تحلیلی از مردا...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه فردوسی مشهد - دانشکده مهندسی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023